深圳市疾病预防控制中心的前身可追溯到50年代初宝安县卫生院的防疫组。2002年，中心在原市卫生防疫站的基础上成立。一代代防疫人员恪守使命，坚持创新，深圳疾控事业伴随着特区的成长而发展壮大。在公共卫生保障上，全市甲乙类传染病发病率由建立特区初期1980年2140.7/10万下降到2009年的216.8/10万，抗击了疟疾、霍乱、SARS、甲型H1N1流感、食物中毒等突发公共卫生事件，消灭了脊髓灰质炎，控制了麻疹、百日咳、破伤风等危害市民健康的疾病，减少了6000多新发艾滋病感染者、10万多乙肝携带者。我市疾控中心一次又一次地证实了自己的实力。在机构建设上，现已从特区成立前的正科级单位、28人编制，发展为目前的正处级单位、270人编制。目前在编人员中：高级职称94人，中级职称41人，初级职称46人；博士17人，硕士59人，本科74人；博士生导师：3名；硕士生导师：8名。并成为国家人力资源和社会保障部（人社部发[2010]60号文）正式批准设立的博士后科研工作站、华中科技大学深圳同济公共卫生研究院和香港中文大学公共卫生学院科研合作单位，拥有卫生部二噁英检测专业实验室、现代毒理学重点实验室、分子生物实验室、病原微生物参比实验室、P3级生物安全实验室等一批优势学科，独立承担国家自然科学基金15项、参与国家“十一五”重大科技专项7项。